全部大写是符合GB/T 7714-2015《信息与文献 参考文献着录规则》的，如果你想要个性化修改，建议使用biblatex-gb7714-2015，看文档修改gbnamefmt，很容易实现你的需求。

\PassOptionsToPackage{quiet}{xeCJK}

\documentclass{article}

\usepackage{filecontents}

\begin{filecontents}{testa.tex}
  \section{test section}
    \begin{table}
      \centering
      \begin{tabular}{c|c}
      a & a \\
      a & a
      \end{tabular}
      \caption{Caption}
      \label{\lpre:XXXX}
    \end{table}

  test \ref{\lpre:XXXX}
\end{filecontents}

\newcommand{\lpre}{\Alph{section}\alph{subsection}}

\begin{document}
\input{testa.tex}
\input{testa.tex}
\end{document}

感谢群内大佬的指点，我这边的需求是被重复导入的子文件一定在某个subsection下，所以使用subsection的计数器来避免重复，大家可以根据自己的需求自行选择合适的计数器。

\usepackage[fontset=windows]{ctex}，直接指定字体配置试试。