中文节标题（section和subsection）距离正文的距离无法调整。

你的代码并不完整，\sanhao,\sihao和\timesnewroman在标准文档类book以及ctex中并没有定义。我无法复现你所说的：

其中section和subsection里面的beforeskip和afterskip，无论调成多少都没有产生变化

有可能是你文档中其他的设置影响了这一弹性长度，因此你需要提供最小工作示例。

\documentclass{book}
\RequirePackage[heading=true]{ctex}
% \setcounter{secnumdepth}{3}
\ctexset{
    % chapter={
    %     % format={\centering\sanhao\heiti\timesnewroman},
    %     aftername=\hspace{\ccwd},
    %     beforeskip={26bp},
    %     afterskip={18bp},
    %     name={第, 章},
    %     fixskip = true, % 添加配置
    %     number=\arabic{chapter},
    %     indent=0bp
    % },
    section={
        % format={\raggedright\heiti\sihao\timesnewroman},
        aftername=\hspace{\ccwd},
        beforeskip={24bp},
        afterskip={60bp},
        fixskip=true,
        number={\thechapter.\arabic{section}}
    },
    subsection={
        % format={\raggedright\banxiaosi\heiti\timesnewroman},
        aftername=\hspace{\ccwd},
        beforeskip={12bp},
        afterskip={60bp},
        fixskip = true,
        number = {\thechapter.\arabic{section}.\arabic{subsection}}
    }
}
\usepackage{zhlipsum}
\begin{document}
    \chapter{00}
    \section{sec000}
        我能吞下玻璃而不伤身体。我能吞下玻璃而不伤身体。
        \subsection{subsec000}
        我能吞下玻璃而不伤身体。我能吞下玻璃而不伤身体。
\end{document}

请你提供最小工作示例(使用"补充问题"功能修改你的问题)，同时建议再次仔细研究ctex宏包的文档.